极地海洋生态系统研究室隶属于海洋科学学院大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室。该研究室具有气相色谱-质谱联用仪（GC-MS）和快速溶剂萃取仪（ASE）等大型仪器，围绕极地（南极和北极）和亚极区海洋生物（尤其是南极磷虾与极地鱼类等）与生态系统中关键科学问题，从生物学、繁殖生态学、摄食生态学与营养动力学等方面开展一系列基础或应用基础研究。

主要研究方向有：

（1）极地与亚极区海洋生物基础生物学；

（2）极地与亚极区海洋生物生长与繁殖；

（3）极地与亚极区海洋生物摄食生态学；